郑芝龙对澳门的物资扼制，如同一场精妙的围城战，不流血却致命。然而，他深知，仅仅依靠经济手段施加压力是远远不够的。在这片弱肉强食的海域，真正的权威必须建立在无可争议的武力之上，必须用一场酣畅淋漓的胜利来铸就和宣告。
他的目光，投向了那个始终不肯臣服、且在荷兰人暗中支持下不断挑战他权威的老对手——盘踞在粤东潮汕一带、与他分庭抗礼的大海盗集团首领，刘香。
刘香，此人与郑芝龙背景相似，亦盗亦商，实力雄厚，麾下战船数百艘，亡命之徒近万。他控制着广东东部至福建部分海域的航线，是郑芝龙实现东南沿海完全霸业的最大绊脚石。
更让郑芝龙无法容忍的是，刘香与荷兰东印度公司（voc）过往甚密。voc一直奉行“以华制华”的策略，试图扶植刘香来制衡、甚至取代郑芝龙，从而获得更优惠的贸易条件和更直接的商品来源。刘香也从荷兰人那里获得了不少火炮和技术支持，气焰日益嚣张。
双方之间的摩擦和小规模冲突持续了多年，互有胜负。但如今，郑芝龙羽翼已丰，决意要彻底拔掉这颗钉子，既是为了肃清后方，更是杀鸡儆猴，做给澳门、荷兰以及所有暗中窥伺的势力看。
1635年（明崇祯八年）春，郑芝龙认为时机已经成熟。他通过各种渠道放出风声，将亲率大军南下巡海，“剿抚不安分之辈”。此举既是宣战，也是试探。
消息传出，各方反应不一。
经过激烈辩论，voc台湾议会最终决定：暂不直接介入，但默许并支持部分荷兰顾问和志愿者以“个人身份”携带少量武器加入刘香舰队，并提供尽可能的情报支持。这是一种典型的、风险可控的“代理人战争”模式。
在澳门，安东尼奥总督则心惊胆战。他既害怕郑芝龙大获全胜后势力更盛，对澳门的控制将更加严密；又隐隐期待刘香能给予郑芝龙重创，或许能缓解自身压力。他下令澳门进入戒备状态，严守中立，同时祈祷这场风暴不要波及自身。
刘香得知郑芝龙大军前来，自恃有荷兰人暗中支持，且熟悉本地水文，决定迎战。他集结了麾下几乎所有精锐战船，联合了其他几股较小的海盗势力，并得到了几十名荷兰雇佣兵和数门较新的火炮支援，舰队规模空前庞大，舳舻相接，帆樯蔽日，屯驻于闽粤交界处的金门、厦门一带海域，摆开了决一死战的架势。
郑芝龙对此毫不意外。他亲自坐镇旗舰——一艘巨大无比、装备超过三十门重型火炮的仿西式三桅炮舰（被称为“龙舰”），麾下战船分为数队，各有分工：其弟郑芝虎率领快速突击船队；另一员猛将杨耿、陈辉等各领一军；甚至还有一支由归附的原荷兰水手操炮的“西洋炮队”。郑氏舰队不仅数量上可能与刘香联军不相上下，更重要的是其组织纪律、战术协同以及火力配置，经过多年整合和模仿西方，已远非普通海盗乌合之众可比。
大战在金门以南海域爆发。
初始阶段，刘香联军凭借数量优势和荷兰顾问指导的炮术，一度与郑氏舰队打得难解难分。炮声震天，硝烟弥漫，火箭如蝗虫般在船舰间飞舞。双方战船不断靠近，接舷战在多个接触点同时展开，刀光剑影，杀声震野，鲜血染红了海面。
郑芝龙站在“龙舰”高大的艉楼上，冷静地观察着战局。他并未急于投入全部预备队，而是像一位经验丰富的猎手，寻找着对手的破绽。
很快，机会出现了。刘香联军虽然声势浩大，但各部之间协调不畅，号令不一。几股海盗头子各怀鬼胎，保存实力，导致阵型出现脱节。而那群荷兰雇佣兵所在的几艘核心战船，虽然火力凶猛，但也显得有些孤立突出。
郑芝龙果断下令：“命令芝虎，率快船队穿插敌阵右翼，分割其与主力的联系！”
“西洋炮队，集中火力，轰击那几艘挂有异样旗帜（指有荷兰人的）的敌舰！”
“杨耿部向左翼施压，牵制敌人主力！”
命令被旗语和号鼓迅速传达。郑芝虎率领的数十艘灵活的快船如同利刃，猛地切入刘香联军阵中，顿时引起一片混乱。而郑氏“西洋炮队”的集中轰击极其精准，猛烈打击了刘香舰队的指挥核心和那几艘有荷兰人助战的战船。
刘香联军开始陷入混乱。部分船只见势不妙，试图转向逃跑，反而冲撞了自家阵型。郑芝龙看准时机，下令全军总攻。
“龙舰”一马当先，巨大的船身如同海上堡垒，侧舷火炮一次齐射就将对一艘敌舰打得千疮百孔。郑氏水兵士气大振，奋勇争先。
战斗变成了一边倒的追杀。刘香主力溃败，船只纷纷被焚毁、击沉或俘获。刘香本人率少数亲信座船拼死突围，但郑芝虎紧追不舍。经过一番惨烈的接舷战，刘香的座舰被团团围住。据说，刘香见大势已去，不愿被俘受辱，最终点燃火药库，自焚而亡（亦有战死或被俘后处决的说法，说法不一）。
金门一战，郑芝龙舰队大获全胜。刘香主力几乎被全歼，其海盗集团就此土崩瓦解。少数残部星散逃亡。那些荷兰雇佣兵，多数战死，少数被俘。
郑芝龙下令打扫战场，将俘获的船只、人员、武器纳入自家麾下。对于被俘的荷兰人，他并未苛刻对待，反而给予相对不错的待遇——他深知这些掌握先进技术的水手和炮手的价值，试图招降他们，为己所用。
胜利的消息以最快的速度传遍东南沿海，并迅速震荡了整个远东海域。
“一场彻底的灾难”
他喃喃道，“郑芝龙的力量，远超我们的预估。他的舰队组织、战术指挥，已经不再是简单的海盗了。”
他不得不紧急调整策略，命令所有voc船只近期尽量避免与郑氏舰队发生冲突，并重新评估与郑芝龙谈判的筹码和方式。武力对抗的选项，被大大降低了优先级。
在澳门，安东尼奥总督听到刘香覆灭、郑芝龙大获全胜的消息时，手中的酒杯差点掉落在地。他感到一阵刺骨的寒意。郑芝龙用一场干净利落的歼灭战，向所有人展示了什么是顺我者昌，逆我者亡。
“上帝啊他的力量已经强大到这种地步了吗？”安东尼奥对议事会成员们说，声音带着一丝颤抖，“刘香有荷兰人暗中支持，尚且落得如此下场我们”他没有说下去，但所有人都明白他的意思。
澳门之前那点试图周旋、甚至暗中期盼郑芝龙受挫的小心思，此刻显得无比可笑和危险。向郑芝龙低头、满足其要求，不再是一个可选项，而是生存的唯一途径。他们派往安海的使者，必须带上更谦卑的态度和更丰厚的礼物。
而在福建安海，凯旋的郑芝龙受到了英雄般的欢迎。他的威望达到了前所未有的顶点。不仅彻底肃清了近海的最大对手，垄断了东南沿海的所有贸易航线，更重要的是，他向所有势力——无论是国内的竞争对手、还是虎视眈眈的西方列强——发出了一个清晰无比的信号：在这片海域，我郑芝龙，才是真正的规则制定者。
他并没有被胜利冲昏头脑。他厚葬了阵亡的对手刘香（以示强者风度），优待荷兰俘虏（展示胸襟并试图获取技术），重赏有功将士。同时，他加强了对沿海各港口的控制，进一步完善了他的“牌饷”制度（向过往商船发放令旗并收取保护费），其海上帝国的架构愈发清晰和稳固。
金门海战，不仅仅是郑氏集团内部的一次权力洗牌，更是东亚海上力量对比的一个决定性转折点。它标志着，一支本土生成的、融合了东西方技术和战术的、拥有强大组织能力和商业头脑的庞大海上力量，已经彻底崛起，成为了主导南海局势的最关键变量。
西方列强们——葡萄牙、西班牙、荷兰、乃至刚刚碰壁的英国——不得不痛苦地接受一个现实：他们未来在远东的任何行动，都必须首先考虑那个坐在安海大宅里、掌控着千帆万船的中国人的态度。
龙已抬头，其威震于四海。接下来的争霸游戏，必须在一个全新的、由郑芝龙参与制定甚至主导的规则下进行了。