天佑元年甲子年（公元904年）
五月丙寅日，朝廷加封河阳节度使张汉瑜为同平章事。
昭宗在崇勋殿设宴款待朱全忠和文武百官，宴席散后，又召朱全忠到内殿赴宴。朱全忠心中起疑，没有进去。昭宗说：“朱全忠不愿意来，那就让敬翔来吧。”朱全忠找个借口打发敬翔离开，还说：“敬翔也喝醉了。”辛未日，朱全忠动身返回东边，乙亥日，抵达大梁。
忠义节度使赵匡凝派遣水军逆着三峡而上，攻打王建占据的夔州，渝州知州王宗阮等人率军将其击败。万州刺史张武打造铁索横截长江中游，在铁索两端修筑营寨，称之为“锁峡”。
六月，李茂贞、王建、李继徽传布檄文，约定合兵讨伐朱全忠。朱全忠任命镇国节度使朱友裕为行营都统，率领几万步兵骑兵迎击敌军；又命令保大节度使刘鄩放弃鄜州，领兵驻守同州。癸丑日，朱全忠亲自率军从大梁出发，向西征讨李茂贞等人。秋季七月甲子日，朱全忠路过东都洛阳，入城朝见昭宗。壬申日，抵达河中。
西川的众将领劝说王建，趁着李茂贞势力衰弱，出兵攻取凤翔。王建就此询问节度判官冯涓，冯涓回答：“兵器是凶险的器物，用兵会残害百姓、耗费钱财，不能穷兵黩武。如今朱温的汴梁军和李克用的晋军像猛虎一样争斗，势不两立，要是他们两家合并为一，发兵攻打蜀地，就算是诸葛亮复活，也抵挡不住。凤翔是蜀地的屏障，不如和李茂贞缔结姻亲，和睦相处。天下太平就督促农耕、训练军队，稳固边疆；局势有变就窥伺时机，等待破绽再行动，这样才能万无一失。”王建说：“说得好！李茂贞虽然是个庸才，但有强悍的名声，远近势力都忌惮他，他和朱全忠硬碰硬较量肯定不够，但自保绰绰有余，让他做我的屏障，好处太多了。”于是王建和李茂贞修复关系、重归于好。丙子日，李茂贞派遣判官赵闳前往西川，替他的侄子、天雄节度使李继崇求婚，王建把女儿嫁给了李继崇。李茂贞多次向王建索要财物和兵器铠甲，王建都如数供给。王建征收赋税十分繁重，百姓没人敢有怨言。冯涓借着王建生日献上颂文，先赞美他的功德，再诉说百姓的疾苦。王建惭愧地道歉说：“有你这样忠心进谏，我还愁什么功业不成！”随即赏赐冯涓金银绸缎。从这以后，赋税征收才稍有减轻。
当初，朱全忠从凤翔护送昭宗车驾返回长安，看见德王李裕眉清目秀，而且已经成年，心里十分厌恶，私下对崔胤说：“德王曾经妄图篡夺帝位，怎么能继续留在世上！你怎么不向皇上进言除掉他！”崔胤把这话转告给昭宗。昭宗质问朱全忠，朱全忠说：“陛下父子之间的事，臣怎么敢私下议论，这是崔胤出卖我啊。”昭宗自从离开长安，每天都担心会有不测，整天和皇后借酒消愁，有时还相对哭泣。朱全忠派枢密使蒋玄晖暗中监视昭宗，昭宗的一举一动他都了如指掌。昭宗曾神色从容地对蒋玄晖说：“德王是我的爱子，朱全忠为什么执意要杀他？”说着就流下眼泪，咬得中指鲜血直流。蒋玄晖把这些事一五一十禀报给朱全忠，朱全忠心里越发不安。
当时李茂贞、杨崇本、李克用、刘仁恭、王建、杨行密、赵匡凝之间互通檄文，都以兴复唐室为借口。朱全忠正领兵讨伐他们，又顾忌昭宗有英明果决的气概，担心宫中发生变故，想要拥立年幼的皇子做皇帝，方便谋划禅让帝位的事。于是他派遣判官李振前往洛阳，和蒋玄晖、左龙武统军朱友恭、右龙武统军氏叔琮等人谋划除掉昭宗。
八月壬寅日，昭宗在椒殿，蒋玄晖挑选龙武军牙官史太等一百人，在夜里敲击宫门，谎称前线有紧急奏报，要当面禀报昭宗。夫人裴贞一开门看见士兵，质问：“紧急奏报为什么要带士兵来？”史太当场杀死了她。蒋玄晖追问：“皇上在哪里？”昭仪李渐荣走到栏杆边大声呼喊：“要杀就杀我们，别伤害皇上！”昭宗当时正喝醉了，急忙起身，穿着单衣绕着柱子逃跑，史太追上后将他杀害。李渐荣用身体护住昭宗，也被史太杀死。蒋玄晖等人又想杀何皇后，皇后向蒋玄晖苦苦哀求，才得以幸免。
癸卯日，蒋玄晖假传诏书，谎称李渐荣、裴贞一谋反弑君，应当拥立辉王李祚为皇太子，改名为李柷，监理军国政事。又假传皇后的命令，让皇太子在昭宗灵柩前即位。宫中上下一片恐惧，连哭出声都不敢。丙午日，昭宣帝李柷即位，当时年仅十三岁。
李克用再次任命张承业为监军。
淮南将领李神福攻打鄂州，久攻不下，恰巧身染重病，于是返回广陵，杨行密任命舒州团练使、泌阳人刘存接替他担任招讨使。不久，李神福病逝。宣州观察使台蒙去世，杨行密任命他的儿子、牙内诸军使杨渥为宣州观察使。右牙都指挥使徐温对杨渥说：“大王卧病在床，却让嫡长子到外地藩镇任职，这一定是奸臣的阴谋。以后要是有人召你回来，只要不是我派去的使者，也没有大王的亲笔命令，千万不要急着回来！”杨渥流着泪道谢，然后启程赴任。
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九月己巳日，朝廷尊奉何皇后为皇太后。
朱全忠率军北上，驻扎在永寿，向南进军到骆谷，凤翔、邠宁的军队始终不敢出兵。辛未日，朱全忠率军返回东边。冬季十月辛卯日，这一天是初一，出现了日食。
朱全忠听说朱友恭等人弑杀了昭宗，假装震惊不已，号啕大哭着扑倒在地，说：“奴才们辜负了我，让我蒙受千秋万代的恶名！”癸巳日，朱全忠抵达东都洛阳，趴在昭宗的灵柩上痛哭流涕，又去拜见昭宣帝，自述弑君之事并非自己的本意，请求出兵讨伐乱臣贼子。在此之前，护卫车驾的士兵有在街市上抢夺百姓粮食的，甲午日，朱全忠上奏朝廷，弹劾朱友恭、氏叔琮不能约束手下士兵，侵扰街市商铺，于是朱友恭被贬为崖州司户，恢复原来的姓名李彦威，氏叔琮被贬为白州司户，不久之后，朝廷又赐二人自尽。李彦威临刑前大声呼喊：“皇上出卖我来堵住天下人的非议，你就不怕鬼神报应吗！做下这样的事，还指望有后代吗！”
丙申日，天平节度使张全义前来朝见。丁酉日，朝廷再次任命朱全忠为宣武、护国、宣义、天平节度使，任命张全义为河南尹兼忠武节度使，兼管六军诸卫事务。乙巳日，朱全忠辞别朝廷，前往藩镇赴任，戊申日，抵达大梁。
镇国节度使朱友裕在梨园病逝。
光州背叛杨行密，投降朱全忠，杨行密派兵包围光州，光州和鄂州都向朱全忠告急。十一月戊辰日，朱全忠亲自率领五万大军从颍州渡过淮河，驻扎在霍丘，分兵援救鄂州。淮南军队紧闭营门，按兵不动，朱全忠命令众将领率军大肆抢掠淮南地区，以此来困住淮南军。
钱镠暗中派遣衢州罗城使叶让去刺杀刺史陈璋，结果事情败露。十二月，陈璋斩杀叶让，起兵反叛，投降杨行密。
当初，马殷的弟弟马賨，性格稳重沉着，起初侍奉孙儒，担任百胜指挥使。孙儒死后，马賨转而侍奉杨行密，屡立战功，升任黑云指挥使。杨行密曾随口询问他的兄弟情况，这才知道他是马殷的弟弟，十分惊讶地说：“我常常奇怪你气度不凡、才能出众，果然不是普通人，我这就派人送你回湖南。”马賨哭着推辞说：“我是从西边溃败逃来的士兵，大王不但不杀我，还宠爱信任我。湖南离这里很近，我时常能听到兄长的消息，我侍奉大王这么久，不愿意回去。”但杨行密坚持要送他回去。这一年，马賨回到长沙，杨行密亲自到郊外为他饯行。
马賨抵达长沙后，马殷上表朝廷，举荐他担任节度副使。有一天，马殷和众将商议向天子进贡的事，马賨说：“杨行密占据的地盘广阔、兵力强盛，和我们接壤，不如和他缔结友好关系，往大了说，能在危急关头成为援军；往小了说，也能互通商旅、获得利益。”马殷脸色一变说：“杨行密不侍奉天子，一旦朝廷出兵讨伐他，罪责会牵连到我们。你别再说这种话了，免得给我招来祸患！”
当初，清海节度使徐彦若临终前留下遗表，举荐副使刘隐暂时代理留后事务，朝廷任命兵部尚书崔远为清海节度使。崔远抵达江陵后，听说岭南地区盗贼横行，又担心刘隐不肯交出兵权，不敢继续前进，朝廷只好召崔远返回。刘隐派遣使者带着重金贿赂朱全忠，朱全忠于是上奏朝廷，举荐刘隐担任清海节度使。
昭宣光烈孝皇帝 天佑二年乙丑年（公元905年）
春季正月，朱全忠派遣众将领率军进军，逼近寿州。
润州团练使安仁义勇猛果敢，深得军心，所以淮南将领王茂章攻打润州，过了一年也没能攻克。杨行密派人对安仁义说：“你的功劳，我不会忘记，要是你能主动归顺，我任命你为行军副使，只是不让你掌管兵权罢了。”安仁义没有答应。王茂章派人挖掘地道，攻入城中，这才攻克润州。安仁义带着全家人登上城楼，淮南军没人敢靠近。在这之前，攻城的众将领见到安仁义就辱骂他，只有李德诚不这样做。到这个时候，安仁义召李德诚登上城楼，对他说：“只有你对我以礼相待，我今天就把这份功劳让给你。”还把自己的爱妾赠送给李德诚。说完就把弓箭扔到地上，李德诚搀扶着他走下城楼，最终安仁义和他的儿子都在广陵街市被斩首。
两浙军队将陈询围困在睦州，杨行密派遣西南招讨使陶雅率军援救。陶雅的军营在夜里发生惊乱，很多士兵越过营垒逃跑，身边的侍从和副将韩球跑来禀报，陶雅却安稳地躺着不动，没过多久军营就自行安定下来，逃跑的士兵也都陆续返回。钱镠派遣堂弟钱镒以及指挥使顾全武、王球率军抵御陶雅，结果被陶雅击败，钱镒和王球都被俘虏带回淮南。
庚午日，朱全忠任命李振掌管青州事务，接替王师范。
朱全忠率军包围寿州，寿州守军紧闭城门，拒不出战。朱全忠只好从霍丘率军返回，二月辛卯日，抵达大梁。
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李振抵达青州，王师范带着全家人向西迁移，走到濮阳时，换上素色衣服，骑着毛驴前进。抵达大梁后，朱全忠把他当作宾客对待。随后朱全忠上表朝廷，举荐李振担任青州留后。
戊戌日，朝廷任命安南节度使、同平章事朱全昱为太师，准许他退休。朱全昱是朱全忠的兄长，为人愚钝朴实，没有才能，之前担任安南节度使，是朱全忠亲自上奏朝廷请求将他罢免的。
这一天是春社日，朱全忠让蒋玄晖把昭宗的几个儿子：德王李裕、棣王李祤、虔王李禊、沂王李禋、遂王李祎、景王李秘、祁王李祺、雅王李禛、琼王李祥，全部邀请到九曲池赴宴。等众人酒兴正浓时，朱全忠下令将他们全部勒死，尸体都扔进九曲池中。
朱全忠派遣部将曹延祚率军，和杜洪一起驻守鄂州，庚子日，淮南将领刘存率军攻克鄂州，生擒杜洪、曹延祚以及汴梁军一千多人，押送到广陵后，全部斩首。杨行密任命刘存为鄂岳观察使。
己酉日，朝廷将圣穆景文孝皇帝（昭宗）安葬在和陵，庙号昭宗。
三月庚午日，朝廷任命王师范为河阳节度使。
戊寅日，朝廷任命门下侍郎、同平章事独孤损为同平章事，充任静海节度使；任命礼部侍郎、河间人张文蔚为同平章事。甲申日，朝廷任命门下侍郎、同平章事裴枢为左仆射，崔远为右仆射，同时免去二人的宰相职务。
当初，柳璨考中进士后，不到四年就当上了宰相，他性格奸邪狡诈、轻佻浮躁。当时昭宗身边的人都是朱全忠的亲信，柳璨就刻意逢迎巴结他们。和他同朝为相的裴枢、崔远、独孤损都是朝廷中有声望的老臣，心里都轻视柳璨，柳璨因此怀恨在心。和王太傅张廷范原本是唱戏的伶人，深受朱全忠的宠信，朱全忠上奏朝廷举荐他担任太常卿。裴枢说：“张廷范是有功勋的大臣，正好担任藩镇节度使，为什么要做太常卿这种掌管礼乐的官职！这恐怕不是元帅的本意。”于是扣下诏书，不肯下发。朱全忠听说这件事后，对身边的宾客僚佐说：“我一直觉得裴枢器量见识纯正质朴，不是轻浮浅薄之辈，看他今天这番言论，原来的面目暴露无遗了。”柳璨趁机在朱全忠面前诬陷裴枢，同时还诋毁崔远和独孤损，所以三个人都被罢免了宰相职务。
朝廷任命吏部侍郎杨涉为同平章事。杨涉是杨收的孙子，为人温和宽厚、恭敬谨慎，听说自己要担任宰相，和家人相对而泣，对儿子杨凝式说：“这是我们家的不幸啊，一定会连累到你。”
朝廷任命清海节度使刘隐为同平章事。
壬辰日，河东都押牙盖寓病逝，他留下遗书，劝说李克用减少营建修缮的工程，减轻赋税，寻访贤才俊杰。夏季四月庚子日，有彗星出现在西北方的天空。
淮南将领陶雅联合衢州、睦州的军队攻打婺州，钱镠派遣弟弟钱镖率军援救婺州。
五月，礼院上奏朝廷，称皇帝即位后应当到南郊祭祀天地，皇上下敕令，定在十月甲午日举行祭祀大典。
乙丑日，彗星的光芒横贯整个天空。
柳璨倚仗朱全忠的势力，肆意作威作福。恰逢出现天象异变，占卜的人说：“君主和大臣都有灾祸，应当通过诛杀来消灾。”柳璨于是趁机在朱全忠面前列举平时和自己结怨的人，说：“这些人都聚众乱发议论，心怀怨恨，口是心非，应当把他们处死来应对天象异变。”李振也对朱全忠说：“朝廷之所以治理不好，都是因为这些士大夫中轻浮浅薄之徒扰乱纲纪；况且您想要成就大业，这些人都是朝廷中难以控制的，不如把他们全部除掉。”朱全忠认为他们说得有道理。癸酉日，朝廷将独孤损贬为棣州刺史，裴枢贬为登州刺史，崔远贬为莱州刺史。乙亥日，将吏部尚书陆扆贬为濮州司户，工部尚书王溥贬为淄州司户。庚辰日，将退休的太子太保赵崇贬为曹州司户，兵部侍郎王赞贬为潍州司户。除此之外，凡是世家大族、科举出身，在三省台阁任职，注重名节、名声稍显的官员，都被指责为轻浮浅薄，接连不断地遭到贬谪放逐，朝中的官员为之一空。辛巳日，朝廷再次贬谪裴枢为泷州司户，独孤损为琼州司户，崔远为白州司户。
甲申日，忠义节度使赵匡凝派遣使者前往西川，和王建缔结友好关系。
六月戊子日，这一天是初一，皇上下敕令，命裴枢、独孤损、崔远、陆扆、王溥、赵崇、王赞等人在各自被贬谪的地方自尽。
当时朱全忠把裴枢等人，以及其他被贬谪的官员三十多人聚集到白马驿，在一个晚上把他们全部杀害，尸体都扔进了黄河。当初，李振多次参加进士考试，始终没能考中，所以十分痛恨士大夫，他对朱全忠说：“这些人常常自诩为‘清流’，应当把他们扔进黄河，让他们变成‘浊流’！”朱全忠笑着听从了他的建议。
李振每次从汴梁到洛阳，朝廷中必定会有官员被贬谪放逐，当时的人都把他比作鸱枭。他见到朝中官员，总是颐指气使，旁若无人。
朱全忠曾经和身边的僚佐以及门客坐在一棵大柳树下，他自言自语说：“这棵树适合做车轮的毂。”众人都不敢应声。有几个门客起身附和说：“确实适合做车毂。”朱全忠突然勃然大怒，厉声说：“你们这些书生，就喜欢随口附和，捉弄别人，都是这副德行！车毂必须用榆木制作，柳木怎么能做！”随即回头对身边的侍卫说：“还愣着干什么！”侍卫几十人一拥而上，把那些说“适合做车毂”的门客全部打死。
己丑日，退休的司空裴贽被贬为青州司户，不久之后被赐死。
柳璨的怒气还没消，还想再诛杀十几个人，张文蔚极力劝阻，他才罢休。
当时士大夫为了躲避战乱，大多不肯入朝为官。壬辰日，朝廷下敕令，命各地州县官员督促他们入朝，不得拖延滞留。前司勋员外郎李延古是李德裕的孙子，辞官后住在平泉庄，诏令下达后，他没有按时动身。戊申日，朝廷将他降职为卫尉寺主簿。
秋季七月癸亥日，退休的太子宾客柳逊被贬为曹州司马。
庚午日夜里，天雄军牙将李公佺和牙军密谋作乱，罗绍威察觉了他们的阴谋；李公佺于是焚烧节度使府衙，大肆抢掠，然后逃奔沧州。八月，王建派遣前山南西道节度使王宗贺等人率军，前往金州攻打昭信节度使冯行袭。
朱全忠因为赵匡凝向东和杨行密互通往来，向西和王建缔结姻亲，乙未日，派遣武宁节度使杨师厚率军攻打他，己亥日，朱全忠亲自率领大军紧随其后。
处州刺史卢约派弟弟卢佶率军攻陷温州，温州刺史张惠逃奔福州。
钱镠派遣方永珍率军援救婺州。
当初，礼部员外郎、掌管诏书起草的司空图辞官后住在虞乡县的王官谷，昭宗多次征召他入朝为官，他都推辞不去。柳璨拿着诏书征召他，司空图心里害怕，只好前往洛阳入朝拜见，故意装作衰老粗鄙的样子，上朝时还故意掉落笏板，举止失态。柳璨于是再次下诏，大致内容是：“你既以隐居为高尚，傲视当代，又像是效仿愚公移山，沽名钓誉。”又说：“你既不像伯夷那样清高，也不像柳下惠那样随和，难以在清明公正的朝廷任职。可以放你回归山林。”司空图是临淮人。
杨师厚率军攻克唐、邓、复、郢、随、均、房七个州，朱全忠率军驻扎在汉水北岸。九月辛酉日，朱全忠命令杨师厚在阴谷口架设浮桥，癸亥日，率军渡过汉水。甲子日，赵匡凝率领两万大军在汉水岸边列阵，杨师厚率军迎战，大败赵匡凝的军队，随即率军逼近襄阳城下。当天夜里，赵匡凝焚烧节度使府城，带着族人以及部下将士沿着汉水逃奔广陵。乙丑日，杨师厚率军进入襄阳；丙寅日，朱全忠率领大军抵达。赵匡凝逃到广陵后，杨行密调侃他说：“你在藩镇任职时，每年都把金银绸缎送给朱全忠，现在战败了，才来投靠我吗？”赵匡凝回答：“诸侯侍奉天子，每年进贡赋税是分内之事，哪里是送给贼人！今天我归顺您，正是因为我不肯依附贼人的缘故啊。”杨行密于是厚待赵匡凝。
丙寅日，朝廷册封皇弟李禷为颍王，李佑为蔡王。
丁卯日，荆南节度使赵匡明率领两万部众，放弃城池逃奔成都。戊辰日，朱全忠任命杨师厚为山南东道留后，然后率军攻打江陵。大军走到乐乡时，荆南牙将王建武派遣使者出城投降。朱全忠任命都将贺瑰为荆南留后。不久，朱全忠上表朝廷，举荐杨师厚为山南东道节度使。
王宗贺等人率军攻打冯行袭，每战必胜。丙子日，冯行袭放弃金州，逃奔均州。他的部将全师朗献出金州城投降。王建为全师朗改名为王宗朗，任命他为金州观察使，从蜀地划出渠、巴、开三个州，归他管辖。
乙酉日，朝廷下诏，将南郊祭祀的日期改在十一月癸酉日。
淮南将领陶雅、陈璋率军攻克婺州，生擒刺史沈夏，带回广陵。杨行密任命陶雅为江南都招讨使，兼任歙、婺、衢、睦四州观察使；任命陈璋为衢、婺二州副招讨使。陈璋率军攻打暨阳，被两浙将领方习击败。方习乘胜进军攻打婺州。
濠州团练使刘金去世，杨行密任命他的儿子刘仁监理濠州事务。
杨行密的长子、宣州观察使杨渥，向来没有好名声，节度使府的文武官员都很轻视他。杨行密卧病在床，命令节度判官周隐去召回杨渥。周隐为人愚笨耿直，回答说：“宣州司徒杨渥轻浮浅薄，容易听信谗言，喜好踢球喝酒，不是能守护家业的人。您的其他儿子都还年幼，没办法驾驭众将。庐州刺史刘威，跟随您从微末起家，一定不会辜负您，不如让他暂时掌管节度使府事务，等您的儿子们长大成人后，再把大权交给他们。”杨行密没有回应。左右牙指挥使徐温、张颢对杨行密说：“大王出生入死，冒着箭林石雨，才为子孙后代创下这份基业，怎么能让外人占有！”杨行密说：“有你们这句话，我死也瞑目了！”周隐是舒州人。有一天，将领僚佐们前来探望杨行密的病情，杨行密用眼神示意，让幕僚严可求留下。众人离开后，严可求问：“大王万一有不测，节度使府的事务该怎么办？”杨行密说：“我已经命令周隐去召回杨渥，现在我忍着不死，就是在等他回来。”严可求于是和徐温一起去见周隐，周隐还没出来见面，征召杨渥的文书还放在案桌上，严可求当即和徐温拿起文书，派遣使者前往宣州召回杨渥。严可求是同州人。杨行密任命润州团练使王茂章为宣州观察使。
冬季十月丙戌日，这一天是初一，朝廷任命朱全忠为诸道兵马元帅，允许他另外开设元帅府。当天，朱全忠部署好将士，准备返回大梁，突然改变主意，想要乘胜攻打淮南。敬翔劝谏说：“如今出兵还不到一个月，就平定了两个强大的藩镇，开拓了几千里的疆土，远近势力听到这个消息，没有不震惊害怕的。这样的威望来之不易，不如暂且返回，休整军队，等待时机再行动。”朱全忠没有听从。
朝廷将昭信军改名为戎昭军，并且把均州划归戎昭军管辖。
辛卯日，朱全忠率军从襄州出发。壬辰日，抵达枣阳，途中遭遇大雨。大军从申州赶往光州，道路狭窄泥泞，人马疲惫不堪，士兵们还没换上冬衣，很多人都逃跑了。朱全忠派人对光州刺史柴再用说：“献城投降，我任命你为蔡州刺史；要是拒不投降，我就血洗全城！”柴再用严加防守，身披铠甲登上城楼，见到朱全忠后，跪拜叩首十分恭敬，说：“光州城小兵弱，不值得让大王动怒。大王要是先攻下寿州，我怎敢不听从命令。”朱全忠在城东停留了十天，然后率军离去。
起居郎苏楷是礼部尚书苏循的儿子，向来没有才德品行，乾宁年间考中进士，昭宗亲自复试后将他除名，还下令永远不许他再进入科举考场。甲午日，苏楷带领同僚上奏说：“谥号的好坏，臣子不能徇私舞弊，先帝的谥号过于溢美，请朝廷重新商议审定。”这件事被下发到太常寺处理，丁酉日，张廷范上奏请求将昭宗的谥号改为恭灵庄愍孝皇帝，庙号襄宗，皇上下诏批准。
杨渥抵达广陵。辛丑日，杨行密秉承皇帝旨意，任命杨渥为淮南留后。
戊申日，朱全忠从光州出发，途中迷失方向，多走了一百多里路，又遇上大雨。等赶到寿州时，寿州守军早已坚壁清野，严阵以待。朱全忠想要包围寿州，却找不到树木修筑营寨，只好率军退守正阳。
癸丑日，朝廷将成德军改名为武顺军。
十一月丙辰日，朱全忠率军渡过淮河向北撤退，柴再用趁机偷袭他的后军，斩杀三千人，缴获的军用物资数以万计。朱全忠懊悔不已，变得更加暴躁易怒。丁卯日，朱全忠回到大梁。
在此之前，朱全忠急于篡夺皇位，暗中派蒋玄晖等人谋划这件事。蒋玄晖和柳璨等人商议：从魏晋以来，篡位的人都是先被册封大国，加封九锡，享受特殊礼遇，然后才接受禅让，应当按照这个顺序一步步进行。于是他们先奏请任命朱全忠为诸道元帅，以此显示循序渐进的姿态，还任命刑部尚书裴迪为送宫告使，朱全忠得知后勃然大怒。宣徽副使王殷、赵殷衡嫉妒蒋玄晖手握大权、深受宠信，想要取代他的位置，趁机在朱全忠面前诬陷蒋玄晖说：“蒋玄晖、柳璨等人想要延续唐朝的国运，所以故意拖延禅让的事，等待局势变化。”蒋玄晖听到消息后十分害怕，亲自赶到寿春，向朱全忠详细说明情况。朱全忠说：“你们这些人编造些无关紧要的话来阻挠我，就算我不接受九锡，难道就不能做天子吗！”蒋玄晖说：“唐朝的气数已经尽了，天命归于大王，无论愚笨还是聪明的人都知道这一点。我和柳璨等人不敢背叛大王，只是现在晋、燕、岐、蜀都是我们的强敌，大王要是仓促接受禅让，他们肯定不会服气，不能不把名分道义做足，然后再夺取皇位，这是想要为大王创立千秋万代的基业啊。”朱全忠怒斥道：“你这奴才果然是谋反了！”蒋玄晖惊慌失措地告辞返回，和柳璨商议尽快为朱全忠加封九锡。当时天子即将举行郊祀大典，文武百官已经演练过礼仪，裴迪从大梁回来，说朱全忠发怒了，还说：“柳璨、蒋玄晖等人想要延续唐朝的国运，才忙着举行郊天祭祀。”柳璨等人十分恐惧，庚午日，他们上奏请求将郊祀大典改到第二年正月的上辛日举行。赵殷衡本来姓孔，名叫孔循，是朱全忠家乳母的养子，所以冒用赵姓，后来逐渐显贵，才恢复了原来的姓名。
壬申日，赵匡明抵达成都，王建用招待宾客的礼节对待他。
昭宗驾崩的噩耗传来时，朝廷派遣告哀使司马卿前往蜀地宣谕王建，到这个时候司马卿才进入蜀地境内。西川掌书记韦庄为王建出谋划策，让武定节度使王宗绾告诉司马卿：“蜀地的将士世代蒙受唐朝的恩德，去年听说皇上的车驾向东迁移，我们一共上了二十道奏表，都没有得到回复。不久前有从汴梁逃来的士兵，说先帝已经惨遭朱全忠杀害。蜀地的将士们正日夜枕戈待旦，想要为先帝报仇。不知道您这次出使蜀地，是为了什么事宣谕？您应当自己考虑何去何从。”司马卿只好返回。
庚辰日，吴武忠王杨行密去世，将领僚佐们一起请求宣谕使李俨秉承皇帝旨意，任命杨渥为淮南节度使、东南诸道行营都统，兼任侍中、弘农郡王。
柳璨、蒋玄晖等人商议为朱全忠加封九锡，朝中大臣大多心怀愤懑，只有礼部尚书苏循公然扬言说：“梁王的功业显赫盛大，天命所归，朝廷应当尽快举行禅让大典。”朝中大臣没人敢反对。辛巳日，朝廷任命朱全忠为相国，总领百官；将宣武、宣义、天平、护国、天雄、武顺、佑国、河阳、义武、昭义、保义、戎昭、武定、泰宁、平庐、忠武、匡国、镇国、武宁、忠义、荆南等二十一道划分为魏国，进封朱全忠为魏王，同时加封九锡。朱全忠嫌他们拖延怠慢，推辞不肯接受。十二月戊子日，朝廷命令枢密使蒋玄晖带着皇帝的亲笔诏书前往大梁，向朱全忠传达旨意。癸巳日，蒋玄晖从大梁返回，说朱全忠的怒气还是没有消解。甲午日，柳璨上奏说：“人心都归向梁王，陛下是时候卸下这沉重的皇位负担了。”当天就派遣柳璨前往大梁，传达禅让皇位的意思，朱全忠拒绝了。当初，柳璨陷害了太多朝中大臣，朱全忠也很厌恶他。柳璨和蒋玄晖、张廷范日夜设宴聚会，结下深厚的交情，一起为朱全忠谋划禅代皇位的事。何太后哭着派宫女阿秋、阿虔去给蒋玄晖传话，说希望他日禅位之后，能保全自己和儿子的性命。王殷、赵殷衡诬陷蒋玄晖，说“他和柳璨、张廷范在积善宫连夜宴饮，对着太后焚香发誓，约定要复兴唐朝的国运。”朱全忠相信了他们的话，乙未日，下令逮捕蒋玄晖以及丰德库使应顼、御厨使朱建武，关押在河南府的监狱里；任命王殷暂代枢密使，赵殷衡暂代宣徽院事务。朱全忠三次上表推辞魏王的封号和九锡的礼遇。丁酉日，皇上下诏批准，改任他为天下兵马元帅，然而朱全忠早已把大梁的节度使府舍修缮成皇宫的模样了。当天，朝廷斩杀蒋玄晖，用棍棒打死应顼、朱建武。庚子日，朝廷裁撤枢密使以及宣徽南院使，只设置一员宣徽使，由王殷担任，赵殷衡担任副使。辛丑日，朝廷下敕令，禁止宫女传达皇帝的诏命以及跟随皇帝上朝。朝廷追削蒋玄晖的官爵，将他贬为凶逆百姓，下令河南府把他的尸体抬到都门外示众，然后召集众人焚烧。
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蒋玄晖死后，王殷、赵殷衡又诬陷他和何太后私通，让阿秋、阿虔牵线搭桥。己酉日，朱全忠秘密命令王殷、赵殷衡在积善宫杀害何太后，然后下敕令废黜何太后为平民，阿秋、阿虔都在殿前被打死。庚戌日，朝廷因为皇太后的丧事，停止上朝三天。
辛亥日，朝廷下敕令，以皇宫内乱为由，取消第二年正月上辛日祭拜郊庙的礼仪。
癸丑日，守司空兼门下侍郎、同平章事柳璨被贬为登州刺史，太常卿张廷范被贬为莱州司户。甲寅日，柳璨在上东门外被斩首，张廷范在京城的街市上车裂而死。柳璨临刑前大喊：“我柳璨是辜负国家的乱臣贼子，死有余辜！”西川将领王宗朗守不住金州，于是焚烧城池，逃奔成都。戎昭节度使冯行袭重新夺回金州，上奏说“金州荒凉残破，请求将治所迁到均州”，朝廷批准了他的请求。朝廷改任冯行袭兼任武安军节度使。
陈询守不住睦州，逃奔广陵，淮南招讨使陶雅率军进入并占据睦州。
杨渥当初离开宣州时，想要带走自己的帐幕和亲兵，观察使王茂章不肯给，杨渥因此怀恨在心。杨渥继位之后，派遣马步都指挥使李简等人率军袭击王茂章。
湖南军队侵犯淮南，淮南牙内指挥使杨彪率军将其击退。
天佑三年丙寅年（公元906年）
春季正月壬戌日，灵武节度使韩逊上奏说，吐蕃七千多名骑兵在宗高谷安营扎寨，准备攻打嗢末，并且夺取凉州。
李简的军队突然抵达宣州，王茂章估计自己守不住，于是率领部众逃奔两浙。他的亲兵、上蔡人刁彦能以母亲年老为由，不肯跟随逃走，还登上城楼晓谕众人说：“王府命令我来招抚你们，大队人马马上就要到了。”众人因此安定下来。陶雅担心王茂章截断自己的退路，于是率军返回歙州，钱镠趁机重新夺回睦州。钱镠任命王茂章为镇东节度副使，给他改名为王景仁。
乙丑日，朝廷加封静海节度使曲承裕为同平章事。
当初，田承嗣镇守魏博时，挑选招募六州的骁勇士兵五千人组成牙军，给他们丰厚的赏赐，让他们保卫自己，作为心腹亲信。从此以后，牙军父子相继，亲信党羽盘根错节，时间久了，他们变得越发骄横跋扈，稍微不如意，就会诛杀原来的节度使，另立新主。从史宪诚开始，历任魏博节度使都是由牙军拥立的。天雄节度使罗绍威心里十分厌恶牙军，但是没有能力制服他们。朱全忠包围凤翔的时候，罗绍威派遣军将杨利言秘密把情况告诉朱全忠，想要借朱全忠的兵力诛杀牙军。朱全忠因为当时战事紧急，没有时间答应他的请求，只是暗中应允。等到李公佺发动叛乱，罗绍威更加恐惧，又派遣牙将臧延范前去催促朱全忠。朱全忠于是征调河南各镇的七万大军，派遣部将李思安率领，会同魏博、镇州的军队驻扎在深州乐城，对外宣称要攻打沧州，讨伐收留李公佺的刘守文。恰逢朱全忠嫁给罗绍威儿子罗廷规的女儿去世，朱全忠派遣客将马嗣勋把兵器铠甲藏在口袋里，挑选一千名常值警卫的士兵扮作挑夫，率领他们进入魏州，谎称是前来参加葬礼的，朱全忠亲自率领大军跟在后面，声称要前往行营，牙军对他们没有丝毫怀疑。庚午日，罗绍威暗中派人进入兵器库，割断所有弓弦和铠甲上的扣环。当天夜里，罗绍威率领自己的家奴门客几百人，和马嗣勋联手突袭牙军。牙军想要应战，却发现弓箭和铠甲都派不上用场，于是整个军营的人都被杀死，一共八千户人家，连婴儿都没有幸免。第二天一早，朱全忠率领大军进入魏州城。
辛未日，朝廷任命暂代宁远留后庞巨昭、岭南西道留后叶广略同为节度使。
庚辰日，钱镠前往睦州。
西川将领王宗阮率军攻打归州，擒获归州将领韩从实。
陈璋听说陶雅返回歙州，于是从婺州退守衢州。两浙将领方永珍等人率军夺取婺州，然后进军攻打衢州。
杨渥派遣先锋指挥使陈知新攻打湖南。三月乙丑日，陈知新率军攻克岳州，赶走刺史许德勋，杨渥任命陈知新为岳州刺史。
戊寅日，朝廷任命朱全忠为盐铁、度支、户部三司都制置使。三司的名称就是从这个时候开始的。朱全忠推辞不肯接受。
夏季四月癸未日，这一天是初一，出现了日食。
罗绍威诛杀牙军之后，魏博的各路军队都十分恐惧，罗绍威虽然多次安抚晓谕他们，但他们的猜忌怨恨反而更加深重。朱全忠在魏州城东安营扎寨几十天，准备北上巡视行营，恰逢天雄牙将史仁遇发动叛乱，聚集几万人马占据高唐，自称留后，天雄军管辖范围内的州县大多响应他。朱全忠把大军转移到魏州城内，派遣使者召集行营的军队返回攻打高唐，行营军队走到历亭时，驻扎在行营的魏博士兵发动叛乱，和史仁遇相互呼应。元帅府左司马李周彝、右司马苻道昭率军攻打叛军，斩杀将近一半的叛军，然后进军攻克高唐，城里的士兵和百姓无论老少都被杀死。叛军首领史仁遇被生擒，最终被锯死。
在此之前，史仁遇向河东和沧州求救，李克用派遣部将李嗣昭率领三千骑兵攻打邢州，以此来救援史仁遇。当时邢州的守军只有二百人，团练使牛存节坚守城池，李嗣昭攻打了七天都没有攻克。朱全忠派遣右长直都将张筠率领几千骑兵援助牛存节守城，张筠在马岭设下伏兵，袭击李嗣昭，将他击败，李嗣昭率军逃走。
义昌节度使刘守文派遣一万大军攻打贝州，又攻打冀州，攻克蓚县，然后进军攻打阜城。当时镇州大将王钊正在宗城攻打魏博叛将李重霸。朱全忠派遣王钊返回镇州援救冀州，沧州军队这才撤退。丙午日，李重霸放弃宗城投奔他处，汴梁将领胡规率军追击，将他斩杀。
镇南节度使钟传任命养子钟延规为江州刺史。钟传去世后，军中立他的儿子钟匡时为留后。钟延规因为没能被立为留后而心怀怨恨，派遣使者向淮南投降。
五月丁巳日，朱全忠前往洺州，然后巡视北部边境，检查防御工事，返回后进入魏州城。
丙子日，朝廷废除戎昭军，将均州、房州划归忠义军管辖。任命武定节度使冯行袭为匡国节度使。
杨渥任命升州刺史秦裴为西南行营都招讨使，率领大军前往江西攻打钟匡时。
六月甲申日，朝廷将忠义军重新改名为山南东道。
朱全忠因为长安邻近邠州、岐州，多次发生战争，于是上奏请求将佑国节度使韩建调任淄青节度使，任命淄青节度使、长社人王重师为佑国节度使。
秋季七月，朱全忠率军攻克相州。当时魏博叛乱的士兵分散占据贝州、博州、澶州、相州、卫州以及魏州下辖的各个县城，朱全忠分别派遣将领率军讨伐，到这个时候全部平定，然后率领大军向南返回。朱全忠在魏州停留了半年，罗绍威为他供应物资，期间宰杀的牛羊猪将近七十万头，粮食物资的数量也和这差不多，另外贿赂赠送的财物又将近一百万，等到朱全忠离开时，魏博的积蓄被消耗一空。罗绍威虽然除掉了牙军的威胁，但魏博的军队从此衰弱下去。罗绍威十分后悔，对别人说：“就算把六州四十三县的铁全部聚集起来，也铸不成我这次犯下的大错啊！”壬申日，朱全忠回到大梁。
秦裴率军抵达洪州，在蓼州安营扎寨。众将领请求靠着水边修筑营寨，秦裴没有听从。钟匡时果然派遣部将刘楚率军占据水边的要害之地。众将领因此埋怨秦裴，秦裴说：“钟匡时手下的骁将只有刘楚一个人罢了，要是他率领部众坚守城池，我们就没办法迅速攻克，我故意用要害之地引诱他出来。”没过多久，秦裴率军攻破刘楚的营寨，生擒刘楚，于是率军包围洪州，饶州刺史唐宝请求投降。
八月乙酉日，李茂贞派遣儿子李侃前往西川做人质，王建任命李侃掌管彭州事务。朱全忠因为幽州、沧州首尾呼应，成为魏博的祸患，想要先夺取沧州，甲辰日，率领大军从大梁出发。
两浙军队包围衢州，衢州刺史陈璋向淮南告急。杨渥派遣左厢马步都虞候周本率领大军前去接应陈璋。周本抵达衢州后，两浙军队解除包围，在城下列阵。陈璋率领部众归顺周本，两浙军队趁机夺取衢州。吕师造说：“浙军靠近我们却按兵不动，这是轻视我们，请下令出击！”周本说：“我奉命接应陈使君，现在他已经到了，我们为什么还要开战！他们肯定是有防备的。”于是率领大军返回。周本亲自率领后卫部队断后，浙军在后面追击，周本在中途设下伏兵，大败浙军。
九月辛亥日，这一天是初一，朱全忠率军从白马渡过黄河，丁卯日，抵达沧州，在长芦安营扎寨，沧州守军紧闭城门，拒不出战。罗绍威负责运送粮草，从魏州到长芦的五百里路上，运输队伍络绎不绝。他还在魏州修建元帅府的馆舍，大军所经过的驿站，都要供应酒食、帐幕、各种器具，上上下下几十万人，没有一样东西不备齐。
秦裴率军攻克洪州，生擒钟匡时等五千人，带回广陵。杨渥亲自兼任镇南节度使，任命秦裴为洪州制置使。
静难节度使杨崇本率领凤翔、保塞、彰义、保义四镇的五万大军，在美原安营扎寨。刘知俊等人率军攻打杨崇本，杨崇本大败，率领残部逃回邠州。武贞节度使雷彦恭多次侵犯荆南，荆南留后贺瑰紧闭城门坚守。朱全忠认为贺瑰胆小懦弱，于是任命颍州防御使高季昌接替他的职位，还派遣驾前指挥使倪可福率领五千大军驻守荆南，防备淮南和蜀地的军队。朗州军队这才撤退。
刘仁恭率军援救沧州，却屡战屡败。于是他下令在管辖境内：“男子十五岁以上、七十岁以下的，全部自备兵器粮草前往行营报到，大军出发之后，要是乡里还有一个成年男子，一律处死，绝不赦免！”有人劝谏说：“现在连老弱之人都要被征发参军，妇女们没办法运送粮草，这个命令要是真的执行，会有很多人被滥杀的！”刘仁恭于是下令，凡是身体强壮能拿得动兵器的人全部参军，在他们的脸上刺字“定霸都”，读书人就在手腕或者手臂上刺字“一心事主”，于是管辖境内的士人百姓，除了小孩之外，没有一个人不被刺字的。刘仁恭一共征集到十万大军，在瓦桥安营扎寨。
当时汴梁军队修筑营垒包围沧州，连飞鸟老鼠都没办法通过。刘仁恭畏惧汴梁军队的强大，不敢出战。沧州城里的粮食已经吃光了，百姓们只好把泥土揉成丸子充饥，甚至出现了人吃人的情况。朱全忠派人劝说刘守文说：“援兵已经来不及了，你为什么不早点投降！”刘守文登上城楼回应说：“我和幽州的刘仁恭是父子关系。梁王您正以大义征服天下，要是做儿子的背叛父亲前来投降，您又怎么会重用他呢！”朱全忠被他的理直气壮说得很惭愧，因此放缓了攻城的节奏。
十月丙戌日，王建开始在蜀地设立行台，他面向东方行礼，放声痛哭，声称“自从皇上的车驾向东迁移之后，朝廷的诏令就再也传不到蜀地了，请求暂时设立行台，效仿李晟、郑畋的旧例，秉承皇帝旨意封官拜爵。”还张贴告示，晓谕自己管辖的藩镇州县。
刘仁恭接连不断地派遣使者前往河东求救，前后多达一百多人。李克用怨恨刘仁恭反复无常，始终没有答应，他的儿子李存勖劝谏说：“如今天下的形势，归顺朱温的人占了十分之七八，就算是像魏博、镇州、定州这样强大的藩镇，也没有不依附他的。黄河以北地区，能成为朱温祸患的，只有我们和幽州、沧州了，现在幽州、沧州被朱温围困，我们要是不跟他们联手抵抗朱温，这对我们是很不利的。争夺天下的人不会计较小小的仇怨，况且他曾经围困过我们，而我们现在却去救他的急难，用恩德安抚他，这是一举两得，既能获得好名声，又能收服他们的人心。这正是我们重振雄风的好时机，千万不能错过。”李克用认为他说得有道理，于是和将领僚佐们商议，征召幽州的军队和河东军队一起攻打潞州，说：“这样做，对他们来说可以解除沧州的围困，对我们来说可以开拓疆土。”于是答应和刘仁恭和解，征召他的军队。刘仁恭派遣都指挥使李溥率领三万大军前往晋阳，李克用派遣部将周德威、李嗣昭率领大军和他们一起攻打潞州。
十一月，刘知俊、康怀贞乘胜攻打鄜州、延州等五个州，全部攻克。朝廷加封刘知俊为同平章事，任命康怀贞为保义节度使。岐州、邠州的军队从此一蹶不振。
湖州刺史高彦去世，他的儿子高澧接替他的职位。
十二月乙酉日，钱镠上表举荐行军司马王景仁，朝廷下诏任命王景仁兼任宁国节度使。
朱全忠派遣几万步兵骑兵，命令行军司马李周彝率领，从河阳出发援救潞州。
闰十二月乙丑日，朝廷废除镇国军兴德府，恢复为华州，划归匡国节度使管辖；划出金州、商州，划归佑国节度使管辖。
当初，昭宗遇害的噩耗传到潞州时，昭义节度使丁会率领将士们身穿白色丧服，痛哭流涕了很久。等到李嗣昭率军攻打潞州，丁会率领全军向河东投降。李克用任命李嗣昭为昭义留后。丁会拜见李克用时，哭着说：“我不是没有能力坚守城池。朱温残害虐待唐朝皇室，我虽然受过他举荐提拔的恩德，但实在不忍心看到他的所作所为，所以前来归顺您。”李克用厚待丁会，让他的地位在众将领之上。
己巳日，朱全忠命令各路军队制造攻城器械，准备攻打沧州。壬申日，他听说潞州已经失守，甲戌日，率领大军返回大梁。
在此之前，朝廷征调黄河南北的粮草，通过水陆两路运送到军营前，各个营寨的粮草堆积如山，朱全忠准备撤军时，下令把这些粮草全部烧掉，火光烟雾绵延好几里，船上的粮草则被凿沉到水里。刘守文派人给朱全忠送信说：“大王要是为了百姓的缘故，赦免我的罪过，解除包围撤军离去，这是大王的恩德。沧州城里有几万百姓，已经好几个月没有粮食吃了。您与其把这些粮草烧成烟雾，沉到水里变成淤泥，不如把剩下的粮草赐给我们，用来救活百姓。”朱全忠因此留下几仓粮草送给刘守文，沧州百姓靠这些粮草得以活命。
河东军队进军攻打泽州，没能攻克，只好撤军。
吉州刺史彭玕派遣使者向湖南请求投降，彭玕原本是赤石洞的蛮族酋长，钟传任用他为吉州刺史。