万界辉光流转，新纪元已过百又三十七载春秋。就在西方沙海秘境尘埃落定之时，东海突然掀起万丈波涛。这一日，玄黄界所有水域无风起浪，海水倒灌三千里，海底传出震天龙吟。
此时林凡眉心的星辰种子与掌心的时之沙同时震颤，在空中投射出完整的四海星图。东海深渊处的光点，正与龙宫位置重合。
林凡与玉瑶仙子乘着避水珠潜入深海。越往深处，景象越发瑰丽：珊瑚成林，珍珠铺路，夜明珠照亮的水晶宫中，隐约可见龙影游弋。更令人震惊的是，宫门前跪拜的不仅是水族，还有无数本应灭绝的上古瑞兽。
水晶宫深处矗立着九道龙门，每道门上都刻着古老道纹。老龟告知，需在祖龙苏醒前通过九重考验，否则龙族暴走将引发灭世洪水。
正当林凡迟疑时，龙门突然碎裂。碎片中走出一位青衣龙女，眉目与玉瑶有七分相似。
玉瑶仙子身形剧震，记忆如潮水涌来。原来她确是龙女转世，而林凡竟是上古时期为护龙族而兵解的道尊转世！
更令人心惊的是，老龟突然现出原形——竟是当年引发道尊兵解的魔族奸细！
魔族奸细催动邪术，龙宫开始崩塌。危急关头，林凡、玉瑶与龙女三人心意相通，星辰种子、九霄琴与龙珠共鸣，化作三光结界护住龙宫核心。
这时林凡发现祖龙真相：所谓祖龙实为天地正气的化身，需要至诚之心才能唤醒。他毅然走向祭坛，不是献祭他人，而是献祭自己对宿命的执着。
当林凡放下执念时，龙宫突然绽放九彩霞光。龙睁开双眼，目光清澈如孩童：
原来所谓苏醒仪式，考验的正是放下执着的勇气。祖龙赐下三片逆鳞，分别赋予三人驾驭水之本源的能力。而魔族奸细在龙光中灰飞烟灭。
随着东海秘境平定，四秘境产生共鸣。星辰古城、沙漠金字塔、极北神山与东海龙宫同时射光柱，在天穹交汇成混沌莲花。
莲花中走出一位道人虚影，正是《》的创始者：