终极决战结束后，叶宸带领联军展开全面的战后清剿。多元宇宙海的各个角落，都残留着混沌大军的残余势力，包括隐藏在各个宇宙群的混沌潜伏者、未被彻底摧毁的混沌据点，以及散落的混沌能量源。
叶宸将联军分成百支清剿小队，由尊主级强者带队，前往各个宇宙群执行清剿任务。凌轩带领一支小队，前往星云宇宙群，清剿隐藏在那里的混沌潜伏者：“至尊战?潜伏清剿！” 至尊战体爆发，金色能量穿透混沌潜伏者的隐匿能量，潜伏者被瞬间斩杀。
星瑶则带领一支小队，前往龙界宇宙群，净化散落的混沌能量源：“至尊火?能量净化！” 彩色火海燃烧，黑色混沌能量被快速净化，转化为精纯的多元本源能量，滋养着龙界的土地。
叶宸则亲自带领核心小队，前往寂灭混沌在多元宇宙海的最后一个据点 —— 混沌裂隙。这里是寂灭混沌能量涌入多元宇宙海的通道，残留着大量的混沌能量和混沌傀儡，由一头战力 的混沌裂隙守护兽守护。
“多元至尊?裂隙破！” 叶宸的金黑色能量劈出，混沌裂隙的入口被瞬间打开。守护兽咆哮着冲来，黑色混沌能量形成一道巨大的利爪：“混沌?裂隙爪！”
“多元至尊?守护兽斩！” 叶宸一剑劈出，金色剑气穿透守护兽的核心，守护兽轰然倒地，被彻底净化：“-！暴击！裂隙绝杀触发！”
进入混沌裂隙，叶宸发现里面隐藏着一座混沌能量核心，正是维持裂隙稳定的关键。他抬手打出金黑色能量，将能量核心彻底摧毁，混沌裂隙开始缓慢闭合，再也无法涌入寂灭混沌能量。
清剿任务持续了一个月，多元宇宙海的所有混沌残余势力被彻底清除，黑色混沌能量被全面净化，各个宇宙群恢复了和平与繁荣。叶宸带领联军返回多元宇宙和平城，召开了盛大的庆功大会。
大会上，叶宸对作战有功的势力和将士进行了重赏：
1、龙界、凤界、星云等宇宙群，获得进入多元宇宙核心修炼场的永久权限，共享寂灭混沌珠的能量；
2、凌轩晋升为多元宇宙联合军团大统帅，星瑶晋升为军团副统帅，两人分别获得 “多元至尊战刃” 和 “多元至尊火珠”，战力突破 和 ；
3、多元宇宙五至尊、金龙尊主、凤凰尊主等顶级尊主，获得寂灭混沌珠的部分能量，战力普遍突破 ；
4、所有参战将士均获得高阶多元本源晶和至尊破寂丹，牺牲将士的名录被刻入 “多元宇宙至尊英烈碑”，永受多元宇宙海生灵的缅怀。
叶宸自己则吸收了寂灭混沌珠的全部能量，战力突破 ，多元至尊法则与寂灭混沌法则完美融合，形成一道全新的 “多元寂灭至尊法则”，能自由操控创造与毁灭两种法则，成为真正的多元宇宙主宰。