第一卷：乱葬岗求生 (第1-50章)
第二卷：希望田崛起 (第51-150章)
第三卷：医道撼仙门 (第151-250章)
第四卷：功德定乾坤 (第251-350章)
(此卷为高潮与结局，目录侧重关键情节节点)
11 身死道消？
60 尾声：但愿世间无疾苦，何妨架上药生尘。
第五卷：功德圆满 (第311-350章)
1 仙盟盛会：百家于新生谷共庆，尊林晚为“医圣”，其调和理念成仙门新基石。
2 系统隐退：功德系统完成使命，悄然隐去，留下一句箴言：“大道在心，汝道已成。”
3 着书传世：林晚闭关，将毕生所学着成《功德医经》与《调和论》，成后世经典。
4 思追悟道：蓝思追结合蓝氏雅正与林晚医道，开创“雅正医脉”，成一代宗师。
5 温宁归真：怨气尽消，温宁恢复生前儒雅容貌，选择留在谷中教书，安宁度日。
6 故地重游：林晚与思追、温宁共游云梦，见莲花坞欣欣向荣，前尘恩怨尽付笑谈。
7 金麟新象：新任金氏家主推行仁政，与新生谷交好，仙门迎来真正和平。
8 海外来使：海外修士慕名渡海来访，求教医道，林晚之道始传于更广阔天地。
9 秘境福泽：林晚早年种下的灵植，演化成一片福地秘境，惠泽后世求道者。
10 薪火相传：林晚首徒独当一面，接下济世医馆馆主之责，传承有序，生生不息。
1 日常烟火：描绘谷中平凡一日，孩童嬉戏，弟子辩经，药香弥漫，充满生活气息。
2 三五知已：林晚、思追、温宁月下小酌，闲话往事与未来，温情脉脉。
3 曦臣问道：蓝曦臣卸下宗主重任后，常来谷中与林晚品茗论道，心境豁达。
4 江澄来访：江澄携莲藕，别扭表达谢意与认可，与林晚、温宁的过往心结彻底消解。
5 阿卯成家：首批流民阿卯成亲，林晚作为主婚人，见证寻常人的幸福。
6 四季轮回：镜头掠过谷中春夏秋冬，展现不同景致与修行生活，时光静流。
7 疑难终解：一例困扰仙门数百年的修行癔症，被林晚以心药医心，彻底根治。
8 灵兽来朝：通灵神兽感知此地祥和，携幼崽迁居谷周山林，成为守护灵。
9 星夜悟道：林晚夜观星海，对生命与宇宙的调和有了更深感悟，境界圆满。
10 佳话频传：各地流传开林晚及其弟子暗中助人、妙手回春的佳话传说。
1 有教无类：一毫无灵根的凡人，凭借一颗仁心与坚韧，被破格收入讲堂。
2 返璞归真：林晚亲自下地照料药田，言说“道在蝼蚁，在稊稗，在瓦甓”。
3 童心之问：谷中孩童天真一问：“林先生，您现在人。”
4 梦中再见：林晚于定中再见魏无羡虚影，二人相视一笑，一切尽在不言中。
5 功德化身：林晚一缕神念化做游方郎中，永世行走人间，暗中扶危济困。
6 百家课本：《调和论》精要部分被纳入仙门启蒙课本，影响一代代新人。
7 神器自晦：阴阳平衡符光华内敛，化为谷中基石，默默调和天地气机。
8 心念通达：林晚感知天下病痛哀愁渐少，喜悦祥和渐增，心生大慰藉。
9 传承之礼：将《功德医经》原本传于首徒，嘱托：“莫忘初心，方得始终。”
10 天地共饮：林晚举杯，敬天地，敬众生，敬过往，敬未来，道心澄澈。
1 又是一年春：新生谷百花盛开，新一代弟子充满朝气。
2 故人渐白头：温宁与思追容貌依旧，却见蓝曦臣、江澄等故人鬓角染霜。
3 人间已无恙：游历归来的弟子汇报，世间纷争大减，医馆遍布，民生安乐。
4 最后的讲学：林晚于谷中最高处，为万千生灵讲最后一课，题为《愿》。
5 化作春泥：林晚功行圆满，在某日晨曦中，肉身化作点点光华，融入新生谷天地，与万物同在。
6 谷中神话：林晚虽去，然谷中每一株草、每一片瓦皆似有她的气息与祝福。
7 思追之梦：蓝思追梦回乱葬岗初遇，林晚对他微笑，转身走入一片温暖的光中。
8 后世记载：史书记载：“医圣林晚，起于微末，成于乱葬，毕生力行调和之道，以功德济世，泽被苍生，乃开万世太平之基。”
9 尾声回响：多年后，一游方郎中医好一孩童，孩童问姓名，郎中笑而不答，转身离去，背影融入熙攘人间。